Os sintomas da doença de Chagas podem variar durante o curso da infecção. A fase aguda, que dura em torno de 4 a 16 semanas,geralmente é assintomática. Porém, quando surgem sintomas, estes podem variar de leves (febre baixa, adinamia,anorexia), moderados (linfoadenopatia, esplenomegalia, hepatomegalia) até graves ( meningite e miocardite). Após a total reversão do quadro clínico agudo, inicia-se uma fase totalmente assintomática. Na metade dos casos o indivíduo infectado com T. cruzi pode manter-se sem sintomas ao longo de toda a sua vida. Esta forma clínica é chamada de 'Indeterminada". A outra metade pode desenvolver cardiopatia, em vários graus, megaesôfago e ou megacólon. O aparecimento destas manifestações ocorrem após décadas da infecção aguda (10 a 40 anos). Esta forma clínica é denominada de forma crônica, e diferente da forma indeterminada, é responsável pela morbimortalidade da doença de Chagas.