Para converter um volume em NTFS a partir do prompt de comando
1.Abra o Prompt de Comando. (Clique em Iniciar, vá em Todos os programas, depois Acessórios e clique em Prompt de Comando.)
2.Na janela de prompt de comando, digite: convert drive_letter: /fs:ntfs
Por exemplo, se você digitar convert D: /fs:ntfs a unidade D: seria formatada com o formato ntfs. Você pode converter volumes FAT ou FAT32 em NTFS com esse comando. Importante Uma vez que uma unidade ou partição foi convertida em NTFS, não é possível simplesmente convertê-la de volta para FAT ou FAT32. Será preciso reformatar a unidade ou partição, o que apagará todos os dados dessa partição, incluindo programas e arquivos pessoais.
https://www.microsoft.com/brasil/windowsxp/pro/usando/artigos/fat_ntfs.mspx