A etiologia da anquilose não está bem definida, sendo, ainda hoje, controversa e desconhecida. Várias são as teorias que tentam explicar esta alteração, dentre as quais destacamos: trauma oclusal, padrão genético e distúrbios metabolismo do local. BIEDERMAN (1956) sugeriu que um distúrbio local poderia ocasionar o desaparecimento do ligamento periodontal anteriormente à reabsorção radicular fisiológica dos dentes decíduos, fazendo com que o osso e a estrutura dental entrassem em contato, resultando em fusão ou anquilose
De acordo com VIA (1964) sua etiologia estaria relacionada ao padrão genético, o qual poderia levar à anquilose.
A teoria do trauma oclusal baseia-se no fato de que forças traumáticas e mastigatórias, reimplante dentário ou injúria térmica ao periodonto poderiam ser responsáveis pela anquilose (MUNDSTOCK & PRIETSCH, 1994).
Contudo, muitas outras causas têm sido apontadas. As comumente citadas incluem: deficiência na força de erupção; possíveis forças que exerçam pressão no arco dentário; morfologia facial; infecção; pressão anormal da língua; crescimento vertical do osso alveolar deficiente; erupção ectópica do primeiro molar permanente; ausência congênita do dente permanente sucessor correspondente e reimplante dental (MENDES & MENDES, 1991; LEITE & RODRIGUES, 1997).