Quando é utilizado o comando Salvar Como (F12, Salvar um cópia do documento, em foramtos ou compatibilidades) eu estou criando um outro arquivo e com isso permaneço com o arquivo original inalterado.
O comando Save (Salvar, Ctrl + B) permite salvar o arquivo que está, no momento, aberto. Se o arquivo já possuir nome, ou seja, já tiver sido salvo pelo menos uma vez, o comando salva as alterações no arquivo de mesmo nome.
Obs.: O Word salva o documento em um local padrão, tal como a pasta Meus Documentos. Para salvar o documento em um local diferente, selecione outra pasta na lista Salvar em na caixa de diálogo Salvar como. Se você quiser alterar o local padrão em que o Word salva os documentos, ajuste as configurações para salvar documentos.