Mais unidades não quer dizer deter o maior quantitativo de índios, atentem-se nesse detalhe.
Ademais, segue um resumo da Amazônia Legal - assunto abordado na questão.
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AMAZÔNIA LEGAL
➥ É o nome atribuído pelo governo brasileiro a uma determinada área da Floresta Amazônica, pertencente ao Brasil, e que abrange nove Estados: Acre, Amapá, Amazonas, Pará, Rondônia, Roraima e parte dos estados de Mato Grosso, Tocantins e Maranhão.
➥ A Amazônia está passando por conflitos entre os diversos atores que compõem o espaço agrário (a exemplo da situação dramática observada no sudeste do Pará). E também, há um desperdício de recursos naturais e da biodiversidade na região.
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BIOMA AMAZÔNICO
✓ É detentor da maior população indígena do Brasil;
✓ É considerado uma fronteira de recursos naturais;
✓ Dispõe de empresas aéreas regionais.
✓ Compreende um conjunto de ecossistemas;
✓ Abrange a Floresta e a Bacia Amazônica;
✓ Não é exclusivo do território brasileiro;
✓ A produção e manutenção de sua biodiversidade estão ligadas a um ciclo anual;
✓ A agricultura e a pecuária são os principais causadores de desmatamento na região.
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Fontes: Alunos do Projetos Missão; Colegas do QC; Questões da CESPE.
Resposta: E
Acho que o erro está em dizer "Dada a cobertura de terras indígenas na amazônia", esse bioma é o que possui mais unidades de conservação em todo o Brasil." pois é como se o autor considerasse que em função da cobertura de terras indígenas na amazônia, o bioma possui mais ucs em todo Brasil.
O que justificaria um grande número de UCS é o fato desse região sofrer constantes pressões antrópicas (garimpo ilegal, extração de madeira ilegal, mineração ilegal, queimada ilegal).
A porcentagem de cada bioma em unidades de conservação não é homogênea: Amazônia, 28%; Caatinga, 8,8%; Cerrado, 8,3%; Mata Atlântica, 9,5%, Pampa, 3%; Pantanal, 4,6%.
Fonte: https://wwfbr.awsassets.panda.org/downloads/factsheet_uc_tema03_2020.pdf