Após terem sido executadas as fases anteriores, chega-se ao momento da implementação e da operação do sistema de gestão ambiental. Esse procedimento compreende essencialmente a capacitação e os mecanismos de apoio. Em síntese, isso significa disponibilizar recursos humanos, físicos e financeiros para que a política, os objetivos e as metas ambientais da organização possam ser viabilizados.
Deve-se ressaltar que no contexto da melhoria contínua da qualidade ambiental, as exigências de capacitação e os mecanismos de apoio evoluem constantemente, ou seja, devem ser aperfeiçoadas ou adequados sempre que se fizer necessário.
Segundo a NBR-ISO 14.001, a implementação e a operação do SGA engloba os seguintes aspectos:
Estrutura e responsabilidade
Treinamento, conscientização e competência
Comunicação
Documentação do SGA
Controle de documentos
Controle operacional
Preparação e atendimento a emergências