Na fonte de ions, as amostras analisadas são ionizados antes da análise no espectrômetro de massa. Uma variedade de técnicas de ionização são utilizadas para a espectrometria de massas. As considerações mais importantes são a energia interna transferida durante o processo de ionização e as propriedades físico-químicas da substância, que pode ser ionizada. É considerado um exemplo de fonte de ionização a pressão atmosférica:
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