O diagnóstico se divide em três categorias principais:
Diagnóstico parasitológico
Diagnóstico imunológico
Métodos moleculares (PCR)
Diagnóstico parasitológico
É o método de diagnóstico mais simples e mais comumente utilizado. É baseado na observação das formas amastigotas pela histopatologia ou citologia utilizando-se esfregaços de medula óssea ou aspirados de linfonodos corados pelo Giemsa. Este método é altamente específico e de baixo custo, mas possui pouca sensibilidade. A utilização da técnica de imunoperoxidase possibilita detecção mais eficiente das formas amastigotas nos tecidos infectados.