A tecnologia FC possui uma estrutura em camadas própria que não segue o modelo OSI. É dividido em 5 camadas:
• FC4: camada mais superior. Responsável por mapear as informações de blocos de dados em iSCSI, por exemplo, em PDU’s para as camadas inferiores;
• FC3: é considerado uma camada de serviços com a capacidade de tratar aspectos de segurança (criptografia) e confiabilidade (RAID). As conexões multiportas são tratadas nessa camada. Também chamada de camada de implementação de protocolos auxiliares.
• FC2: é a camada de rede de dados. É a principal camada do modelo onde atuam os principais protocolos. As conexões ponto a ponto atuam nessa camada. Define ainda a estrutura dos frames e os protocolos de sinalização, controle fluxo, e classes de serviço.
• FC1: camada de codificação do sinal, também chamada de camada de enlace de dados. Implementa recurso de controle de erros.
• FC0: camada mais inferior que contempla cabos, conectores e outros. Também chamada de camada física;