Podemos classificar os Sistemas de Informação em saúde, conforme sua natureza, em:
•Sistemas de Informações Estatístico-epidemiológicas: aqueles que incluem o conhecimento da mortalidade e suas causas determinantes, do padrão de morbidade da população ou da demanda atendida pelos serviços, dos aspectos demográficos, sociais e econômicos e suas relações com a saúde da população.
•Sistemas de Informações Clínicas: dados clínicos sobre o paciente, desde sua identificação, problemas de saúde relatados, diagnóstico médico, até exames clínicos, laboratoriais, radiológicos, gráficos, procedimentos cirúrgicos realizados ou medicamentos prescritos, dentre outros.
•Sistemas de Informações Administrativas: não específicas do setor da saúde, são as de controle de estoque, materiais, equipamentos, gestão financeira.
O conjunto das informações clínicas, estatístico-epidemiológicas e administrativas compõe o Sistema de Apoio à Decisão em Saúde.