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A auditoria pode ser classificada em prospectiva, operacional e/ou retrospectiva.
A auditoria prospectiva consiste no método prévio, com caráter preventivo, cuja finalidade é evitar problemas.
A operacional, também denominada de concorrente, é realizada enquanto o cliente recebe a prestação de serviços.
Atua nas áreas inter-relacionadas do órgão/autarquia, avaliando a eficácia dos seus resultados em relação aos recursos materiais, humanos e tecnológicos disponíveis, bem como a economicidade e eficiência dos controles internos existentes para a gestão dos recursos públicos. Sua filosofia de abordagem dos fatos é de apoio, pela avaliação do atendimento às diretrizes e normas, bem como pela apresentação de sugestões para seu aprimoramento.
A auditoria retrospectiva é aquela executada após o cliente receber pelos serviços.
Não encontrei a classificação relacionada a auditoria em conformidade.
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Uma auditoria que busque verificar a regularidade dos atos de gestão praticados com foco em legalidade e legitimidade dos atos é chamada de auditoria de regularidade ou de conformidade. É por meio da auditoria de conformidade que se busca identificar fraudes e desvios de recursos.
Quando o objetivo é avaliar o desempenho da gestão de um órgão, processo ou serviço, a auditoria é denominada auditoria operacional ou de desempenho
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Na auditoria de conformidade, examina-se a legalidade dos atos de gestão dos responsáveis sujeitos a sua jurisdição quanto ao aspecto assistencial, contábil, financeiro, orçamentário e patrimonial; (conformidade visa avaliar a questão financeira, desvios de verbas, etc)
Na auditoria operacional, por sua vez, avaliam-se os sistemas de saúde, observando-se aspectos de eficiência, eficácia e efetividade. Concentra- se nas condições da rede física, nos mecanismos de regulação e no desenvolvimento das ações de saúde