A coloração por hematoxilina férrica tem como objetivo o estudo morfológico de protozoários após sua fixação por algum método citológico. Este método é mais utilizado quando se pretende diagnosticar amebíase em pacientes com diarreia ou disenteria, ou quando as fezes são obtidas após a aplicação de purgativo salino ou enema. A coloração deve ser feita preferencialmente nos primeiros 20 minutos após a evacuação. Na impossibilidade disto, o material deve ser conservado no fixador de Schaudinn, refrigerado.
Este fixador é utilizado para preservar protozoários encontrados em fezes líquidas ou em amostras da mucosa intestinal. É muito usado na preparação de esfregaços permanentes corados, principalmente, com a hematoxilina férrica.