Cinco condições têm maior influência sobre os processos de nitrificação e desnitrificação:
1 - pH do solo: nitrificação mais baixa em solos ácidos, sendo o teor ótimo de 8,5
2 - Umidade: bactérias nitrificadoras permanecem ativas sob condições muito secas e inativas em solos inundados.
3- Temperatura: a nitrificação se inicia à partir da temperatura de congelamento até 30°C, decrescendo acima dessa temperatura.
4 - Aeração: é um processo que requer oxigênio.
5 - Resíduos de culturas (Relação C/N): grandes quantidades de resíduo e baixo oxigênio aumentam as reações de desnitrificação e perda de nitrogênio.