Valproato se associa com risco de malformações fetais em 3-5% dos casos, principalmente defeitos do tubo neural. O risco é maior no primeiro trimestre . Todas as mulheres em idade fértil devem ser tratadas concomitantemente com ácido fólico.
Há também risco de prejuízo cognitivo nas crianças cujas mães usaram valproato na gestação (dose-dependente); risco aumentado de autismo.
Não há contra-indicação na amamentação durante uso de valproato.
Mulheres jovens podem ter problemas como ovário policístico, hirsutismo, acne, ganho de peso e irregularidades menstruais.