Entre o(s) objetivo(s) da Contra-Reforma podemos destacar:
I. reforçar os dogmas do Catolicismo abalados pelo Concílio de Trento (1545- 1563).
II. criar mecanismos de combate às heresias que se multiplicaram na Baixa Idade Média como um sintoma da crise da ordem feudal.
III. investigar e punir crimes contra a fé católica - a exemplo da afirmação da transubstanciação, através do tribunal do Santo Ofício.