Letra A - Incorreta, pois a competência para promover a remissão como forma de exclusão do processo é do Ministério Público
Art. 126. Antes de iniciado o procedimento judicial para apuração de ato infracional, o representante do Ministério Público poderá conceder a remissão, como forma de exclusão do processo, atendendo às circunstâncias e conseqüências do fato, ao contexto social, bem como à personalidade do adolescente e sua maior ou menor participação no ato infracional.
Letra B - Incorreta, pois o Ministério Público não detém competência para decidir sobre destituição do poder familiar, esse procedimento tem que passar pelo crivo do poder judiciário.
Letra C - Incorreta.
Letra D - Correta, é o que dispõe o artigo 148, inciso V do ECA:
Art. 148. A Justiça da Infância e da Juventude é competente para:
V - conhecer de ações decorrentes de irregularidades em entidades de atendimento, aplicando as medidas cabíveis;
Letra E - Incorreta.