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O processo de tratamento por lagoas facultativas é muito simples e constitui-se unicamente por processos naturais. Estes podem ocorrer em três zonas da lagoa: zona anaeróbia, zona aeróbia e zona facultativa.
Se na lagoa facultativa há zona aeróbia e zona facultativa, logo ela não pode ser um dito sistema anaeróbio.
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No sistema de lodos ativados o processo biológico que ocorre dentro do tanque é todo aeróbio.
Lodo ativado é o lodo resultante de um processo de destinado à destruição de biodegradáveis presentes em águas residuárias, e . O processo se baseia na oxidação da matéria orgânica, por , controlada pelo excesso de em tanques de aeração e posteriormente direcionado aos decantadores. O lodo decantado nos decantadores retorna ao tanque de aeração como forma de reativação da população de bactérias no tanque de aeração. Este retorno se dá na entrada do tanque onde o lodo em fase endógena se mistura ao efluente rico em poluente, aumentando assim a eficiência do processo.
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Letra C aborda os sistemas aeróbicos mais comuns. Os anaeróbicos são: Reator UASB, lagoa anaeróbica, fossa séptica