A técnica conhecida como hibridação de Southern Como qualquer outra técnica de hibridação de ácidos nucleicos baseia-se na capacidade destas moléculas, quando em cadeias simples, se poderem associar formando cadeias duplas, estáveis, em resultado do estabelecimento de ligações de hidrogénio entre duas cadeias simples que apresentam sequências de nucleótidos com bases complementares. Quando as duas cadeias simples, que se associam, são de proveniência diferente, forma-se uma cadeia híbrida e daí o nome hibridação.