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Prova FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA


ID
1706083
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Analise as afirmativas a seguir sobre a amplificação de DNA Antigo (de subfósseis, de material de coleções, etc.).

I. Com a DNA polimerase de uma extremófila, a técnica de PCR possibilitou a amplificação, a partir de uma única sequência, de DNA para níveis sequenciáveis.

II. A principal dificuldade na amplificação de DNA Antigo é a diferença na qualidade do DNA alvo e do DNA contaminante, necessitando testes de xenologia para garantir a origem do DNA amplificado por PCR.

III. O teste apresenta maiores dificuldades quando o DNA alvo vem de organismos próximos filogeneticamente ao de espécies que contaminariam a amostra, como humanos.

Assinale: 

Alternativas

ID
1706086
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Mutações são consequência de erros da enzima DNA polimerase e todos os genes codificadores de proteínas de um mesmo genoma são polimerizados pela mesma enzim. Assim, a melhor explicação da razão de porque genes diferentes apresentam taxas diferentes de evolução molecular é a de que:

Alternativas
Comentários
  • Correta letra D!!!!

    Isso corre por que um organismo que sofre mutação numa proteína importante terá menor aptidão, diminuindo suas chances de sobrevivência e reprodução (portanto, reduzindo sua representação nas próximas gerações), temos o que se chama de “seleção natural negativa (ou purificadora)”. 


ID
1706089
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Sobre as taxas de transições (s) e de transversões (v), é correto afirmar que:

Alternativas

ID
1706092
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

A respeito dos genomas, analise as afirmativas a seguir.

I. O paradoxo do valor de C (C-value paradox, em inglês) é observação da relação inversa entre tamanho do genoma e complexidade do organismo, pois alguns protistas apresentam os maiores genomas já descobertos.

II. A teoria dos abrigos seguros (safe haven theory, em inglês) sugere que transposons têm tendência a se deslocar para locais com poucos genes no genoma. Assim, genomas grandes e cheios de transposons tendem a crescer mais rápido do que genomas pequenos.

III. Cromossomos B são cromossomos supranumerários, não essenciais que estão presentes no genoma de animais, plantas, e outros organismos.

Assinale: 

Alternativas

ID
1706095
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Alguns autores hoje encaram o sequenciamento do genoma humano como um dos feitos mais importantes da humanidade. Entretanto, quando as metas e o custo estimado do projeto genoma humano foram divulgados, muitas questões apareceram sobre o propósito de gastar uma quantidade expressiva de dinheiro para sequenciar o genoma humano. A resposta mais frequente na mídia versava sobre o fato de que o sequenciamento do genoma humano iria nos ajudar a entender o que nos torna humanos. Sobre o tema, analise as afirmativas a seguir. 

I. A variabilidade interespecífica é uma questão importante nesses casos, pois um único genoma não irá ilustrar a diversidade genética da população humana.

II. O sequenciamento do Homo neanderthalensis publicado em 2010 sugeriu que houve cruzamento deste hominídeo com Homo sapiens fora do continente africano.

III. Um problema da anotação dos primeiros sequenciamentos de genoma humano é o fato de terem sido feitos com base em buscas de homologia com o genoma de Caenorhabditis elegans, que não apresenta ancestral comum com humano.

Assinale:

Alternativas
Comentários
  • Pq o item I está errado?

  • a variabilidade interspecífica é entre espécies diferentes. o termo correto seria variabilidade intraespecífica.
  • A letra B está correto


ID
1706098
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biologia
Assuntos

Sobre a replicação do DNA e a redundância do código genético, assinale a alternativa incorreta.

Alternativas
Comentários
  • Alguém poderia me explicar esta questão? :)

  • Gabarito letra C.

    a) Correta.  A primeira base do anticódon (no sentido 5'-3') é quem determina o número de códons que será reconhecido pelo RNAt, assim, se for a base I (iosinato- uma base pouco conhecida por nós estudantes), ela poderá formar ligações com U, C e A, na terceira base do códon (daí o motivo do nome de base oscilante) e originar o mesmo AA (lembrem-se que eu posso ter mais de um códon para o mesmo AA, mas não o oposto). Dessa forma, mudanças de base na terceira posição do códon (no sentido 5'-3') serão pouco capazes de alterar o aminoácido.

    b) Correta. A posiçao degenerada, caso exista, é a terceira, nunca a primeira e a segunda (segue o mesmo raciocínio da assertiva 'a')

    c) Incorreta. Mutações não sinônimas são as que dão origem a um AA diferente daquele de antes da mutação. Genes house keeping são genes constitutivos, ou seja, que possuem uma expressão constante no organismo. Ora, se o gene tem expressão constante podemos deduzir que o seu produto é altamente demandado, dessa forma, se houver uma mutação capaz de alterar o AA, ela também alterará a proteína expressa, o que comprometeria o metabolismo/função/fenótipo do organismo. Isso seria um contracenso, pois teríamos mais organismos com características desfavoráveis que favoráveis.

    d) Correta. Entre códons sinônimos existe aquele que é mais demandando, esse acaba por ter maior taxa de ocorrência no organismo e, por consequência, mais transcrito. Dessa forma, a proporção entre ele e outros códons que codificam o mesmo AA é muito diferente, sendo menos equitativa.

    Qualquer incoerência, mandem mensagem.


ID
1706101
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Células procariontes e eucariontes diferem em estrutura celular, nos processos moleculares e, naturalmente, em conteúdo gênico. Dentre as maiores dificuldades em conseguir a expressão de genes eucariontes em células procariontes está o fato de que:

Alternativas

ID
1706104
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biologia
Assuntos

Sobre o DNA, assinale a alternativa incorreta.

Alternativas
Comentários
  • Base nitrogenada (português brasileiro) ou base azotada (português europeu) é um composto cíclico contendo nitrogênio.

    São cinco as bases desse tipo, divididas em dois grupos:

    • Purinas (Adenina e Guanina), possuem duplo anel de átomos de carbono e derivam da purina
    • Pirimidinas (Citosina, Timina e Uracilo), possuem anel simples

    As bases nitrogenadas se ligam com uma pentose (um açúcar) e com um grupo fosfato. Essas estruturas se organizam em pares, formando assim o DNA, caso a pentose seja a desoxirribose. As bases organizam-se aos pares (sempre Adenina-Timina, citosina-Guanina). No caso do RNA, o açúcar com que as bases se ligarão será a ribose e no lugar da Timina entrará o Uracilo (A-U e C-G).

  • A Timina é uma pirimidina e possui apenas um anel em sua estrutura.

    LETRA E


ID
1706107
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biologia
Assuntos

A teoria mais aceita sobre a origem das mitocôndrias e dos cloroplastos é a chamada Teoria de Endossimbiose Serial (Serial Endosymbiont Theory, em inglês) da pesquisadora Lynn Margulis. Em sua teoria, Lynn propôs que mitocôndrias e cloroplastos seriam originários de eventos de endossimbiose de procariontes (bactérias púrpura e cianobactérias, respectivamente) que teriam acontecido em células eucarióticas primitivas. Analise as afirmativas a seguir sobre as evidências para essa teoria. 

I. Boa parte do conteúdo gênico original das mitocôndrias está transferido para o genoma nuclear de animais, por isso encontramos poucos genes quando comparamos com os genomas mitocondriais de plantas.

II. O metabolismo da fotossíntese é, na realidade, consequência de eventos independentes e homoplásticos de endossimbiose na linhagem das cianobactérias, das plantas e das algas verdes.

III. Genoma próprio e dupla membrana são evidências do passado dessas organelas como organismos procarióticos.

Assinale: 

Alternativas
Comentários
  • Excelente comentário!

  • Excelente comentário!


ID
1706110
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Sobre a comparação de entre genomas de eucariontes e procariontes e assinale a afirmativa incorreta.

Alternativas

ID
1706113
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

O DNA é composto por duas cadeias de nucleotídeos lado a lado retorcidos sob a forma de uma dupla hélice. Sobre a estrutura do DNA, assinale a alternativa incorreta.

Alternativas
Comentários
  • As bases nitrogenadas estão ligadas ao carbono 1' da desoxirribose


ID
1706116
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Durante a replicação do DNA são formados os fragmentos de Okazaki. Indique, dentre as sentenças que discorrem sobre os fragmentos de Okazaki, a incorreta.

Alternativas
Comentários
  • Se são formados durante a replicação do DNA, por meio do mecanismo de leitura descontínua da DNA polimerase, como poderiam ser os fragmentos de Okazaki formados pelo açúcar ribose (presente no RNA)?

    Alguém mais percebeu o erro?

  • A FGV trata os fragmentos de okazaki como primers, quando na verdade são constituidos tanto de fragmentos de DNA quanto de RNA (primers). Se você responder a questão com o pensamento da FGV consegue acertá-la.. 

  • Essa questão é realmente confusa, pois a alternativa C que eles consideram incorreta, na verdade na minha opinião está correta, pois os fragmentos são incorporados na fita de DNA, o que sai são os primers retirados pela polimerase I no caso de procariotos e no caso de eucariotos quem retira os primers são duas nucleases, a ribonuclease H1 e a FEN-1.

  • Esta questão está errada.
    DNA polimerase constroi os fragmentos de Okazaki, logo, impossível ter a Ribose como pentose (a), não são tem a participação da RNA polimerase(d), e não sao degradados pela DNA polimerase I (e). Essas alternativas se aplicam mais aos Primers que aos Fragmentos de Okazaki.

  • "Os fragmentos de Okazaki são INCORPORADOS a fita de DNA gerada na replicação.

    Os fragmentos de Okazaki formados durante o processo (híbridos de DNA e RNA), não são incorporados ao final do processo, pois os primers de RNA são removidos e substituídos por segmentos de DNA, antes de serem unidos pela DNA ligase.


ID
1706119
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

A hibridização subtrativa é um método poderoso para identificação de genes diferencialmente expressos. Assinale a etapa que não faz parte do método usualmente realizado de hibridização subtrativa.

Alternativas
Comentários
  • Gab B

    O DNA não é susceptível a hidrólise alcalina, enquanto o RNA é facilmente hidrolisado, produzindo uma mistura equimolar de 2’e 3’-nucleosídeo monofosfato.


ID
1706122
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Para o início da transcrição de um gene são necessárias uma região promotora e uma série de proteínas auxiliares. Assinale a alternativa incorreta sobre região promotora e as proteínas necessárias para o início da transcrição em bactérias.

Alternativas

ID
1706125
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

A descoberta do sistema Lac foi crucial para a melhor compreensão de como ocorre a regulação da transcrição gênica. Sobre o sistema Lac, assinale a alternativa incorreta.

Alternativas

ID
1706128
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Sobre as diferenças e as semelhanças entre a regulação transcricional em bactérias e eucariontes, assinale a alternativa incorreta.

Alternativas

ID
1706131
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

A clonagem de moléculas de DNA envolve a utilização de uma série de enzimas. Sonre essas enzimas e suas respectivas funções, assinale a alternativa incorreta.

Alternativas
Comentários
  • Fosfatases alcalinas podem remover um grupamento fosfato presente na ponta 5' de uma molécula de DNA.

  • Na extremidade 5' da fita de DNA está presente o grupo fosfato, enquanto na extremidade 3' está presente o grupo hidroxila, o qual sofre o ataque nucleofílico para extensão da cadeia. 

    Portanto, soou meio extrano afirmar que - Fosfatases alcalinas podem remover um grupamento fosfato presente na ponta 3' .


ID
1706134
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

As enzimas utilizadas para manipular o DNA podem ser divididas em grupos, dependendo do tipo da reação que elas catalisam. Um grupo de enzimas praticamente não utilizado para manipulação do DNA é o das:

Alternativas

ID
1706137
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

A enzima fosfatase alcalina pode ser muito útil para a produção de moléculas recombinantes. A função desta enzima é:

Alternativas

ID
1706140
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Umas das técnicas mais utilizadas atualmente para a comparação de duas populações de RNA é a Hibridização subtrativa por supressão (Supression subtrative hybridization, SSH do inglês). Sobre o tema, assinale a alternativa incorreta

Alternativas
Comentários
  • Duas populações de mRNA podem ser comparadas por técnicas subtrativas, que realçam as diferenças entre elas. Assim, são clonados genes que são expressos em uma situação e não em outra. Embora existam vários métodos, a teoria por trás deles é simples. Primeiro, ambas populações são convertidas a cDNA. Nesta técnica que vamos descrever, é comum chamarmos de "tester" a população de cDNA que apresenta alguns genes especificamente expressos e o cDNA de referência é chamado de "driver". Tester e driver são hibridizados e as seqüências híbridas são removidas. Consequentemente, o cDNA que não hibridizou representa genes que são expressos no tester e não no driver.

    Primeiro o extrai-se RNA total das duas amostras e purifica-se com resina de oligo-dT o RNA poly A+, enriquecido portando de mRNA. O cDNA é sintetizado a partir do mRNA (é necessário 0,5 - 2 mg). Digere-se o cDNA tester e driver com uma enzima de restrição que corta com alta frequência, pois seu sítio de restrição exige apenas o reconhecimento de 4 bases (enzima Rsa I por exemplo) e que produz extremidades cegas (as duas fitas têm o mesmo comprimento). Divide-se agora o cDNA tester em duas porções e cada uma é ligada a um adaptador (uma pequena molécula de DNA dupla fita) diferente. Como os adaptadores utilizados não contêm fosfato presente na extremidade 5', apenas uma de suas fitas é covelentemente ligada ao cDNA. As duas preparações de tester são hibridizadas, separadamente, com excesso de driver, de forma que o cDNA que existe somente nas preparações tester irá permanecer simples fita. Uma segunda hibridização é feita misturando-se as duas preparações sem desnaturá-las, para que as fitas exclusivas do tester de uma preparação hibridizem com as fitas exclusivas do tester da outra. Para garantir, adiciona-se ainda uma quantidade de driver frescamente desnaturado para impedir a dimerização de moléculas dos dois tipos de driver que não são diferencialmente expressas. Incuba-se a mistura agora com DNA polimerase para que haja síntese das fitas "crick" dos adaptadores. Serão produzidas moléculas com adaptadores nas duas pontas (adaptadores iguais ou diferentes). Utilizando agora iniciadores que com a seqüência que é idêntica em ambos tipos de adaptador, é possível a amplificação por PCR das moléculas que contém um tipo de adaptador em cada extremidade. Note que essa amplificação foi gerada por moléculas presentes nas duas preparações de tester que não hibridizaram com o cDNA driver e puderam portanto hibridizar entre si. Portanto, representam moléculas ausentes no driver. Em seguida à primeira PCR, é realizada outra com iniciadores mais internos, que precisam hibridizar simultaneamente em ambas extremidades, iniciadores equivalentes portanto às regiões diferentes dos dois adaptadores.


ID
1706143
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Sobre o BLAST, analise as afirmativas a seguir.

I. A identificação de sequências pelo BLAST apresenta um problema de circularidade associada a identificação.

II. BLAST fornece uma medida do grau de homologia, isto é ancestralidade comum, entre as duas sequências comparadas.

III. Uma ferramenta comum para inferência de ortologia entre duas sequências de genomas diferentes é usando a ferramenta BBH (Best bi-directional hit, em inglês).

Assinale: 

Alternativas

ID
1706146
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Pongo                         GACACAACCTCA-ACTAGCGG--------ATAAA

Gorilla                         TACTAAGCCTAG-GCCTACTCT-----CTATAAT

Pan paniscus                TATATATCCTGACACTAATACTAA--TAGAAAAA

Pan troglodites             CATCTACCTCCACATTGGTCGCGGT-TTTTACTA

Homo sapiens              CAATCGCTGAGTCACCAATCGCTTC-TCCACCCT

Hylobates                    CTTTCATTACTTAGCAGGTGTTTCCTCCATTCTA

Com base na figura acima, é possível afirmar que as sequências parciais de primatas: 

Alternativas

ID
1706149
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Analise as seguintes afirmativas sobre bancos de dados genéticos.

I. Swiss-Prot é um banco manualmente curado não-redundante de proteínas anotadas em detalhes.

II. GenBank é um banco não-curado não-redundante de sequências de DNA.

III. UniGENE é um banco não-curado redundante de sequências de transcritos primários.

Assinale: 

Alternativas

ID
1706152
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biologia
Assuntos

Preencha a lacuna corretamente em relação aos algoritmos exaustivos de busca de árvores.

O número de árvores filogenéticas enraizadas possíveis __________ número de sequências analisadas.

Alternativas

ID
1706161
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Um pesquisador estava fazendo um estudo comparativo entre genomas de duas espécies de plantas. Em particular, ele analisou sequências de dois genes não homólogos codificadores de proteínas. Dentre as metodologias de análise, ele calculou a proporção de nucleotídeos diferentes pelo total de nucleotídeos comparados (p).

Sobre o tema, analise as afirmativas a seguir.

I. Quando comparado com íntrons do mesmo gene, os éxons vão mostrar um p maior entre as espécies de plantas.

II. As proteínas não homólogas irão mostrar uma proporção de 25% de aminoácidos idênticos.

III. O numerador de p é exatamente o somatório do número de transições com o de transversões entre as sequências.

Assinale: 

Alternativas

ID
1706164
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Um técnico acabou de sequenciar um fragmento de uma região codificadora de uma enzima para quatro espécies de roedores. Examinando o alinhamento múltiplo final, a explicação mais provável para o padrão encontrado é: 

Seq. 1: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 2: ATG GAA GAA ATT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 3: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 4: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

A explicação mais provável é que: 

Alternativas

ID
1706167
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

A maior parte dos algoritmos de alinhamento múltiplo de sequências faz uso de uma matriz de pontos (dot-matrix). Na primeira fase do alinhamento par a par, cada par de sequências é disposto nesta matriz com uma sequência na primeira linha e a outra na primeira coluna.

Todos os pares possíveis de sequências são analisados na matriz de pontos, onde um ponto indica ____________ das duas sequências a serem alinhadas par a par.

Assinale a alternativa que complete corretamente a frase acima. 

Alternativas

ID
1706170
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Um pesquisador está tentando sequenciar um gene conservado de um pombo. Entretanto, no momento de escolher os primers para PCR, ele observou que não dispõe de primers, para as regiões flanqueadoras do gene, específicos para Aves. Os primers disponíveis no laboratório estão os que foram desenhados para as espécies indicadas nas alternativas.

Assinale a melhor escolha de forma a otimizar a probabilidade de amplificação do fragmento em questão. 

Alternativas

ID
1706173
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Sobre alinhamentos de sequências de DNA, é correto afirmar que:

Alternativas
Comentários
  • Paralogia: homologia por duplicação.

    Ortologia: homologia por especiação.


ID
1706176
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

A enzima DNA polimerase é responsável pela replicação do DNA, no entanto ela não atua sozinha durante este processo. Assinale abaixo a afirmativa que indica um componente que não atua na replicação do DNA.

Alternativas

ID
1706179
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Plasmídeos são moléculas circulares de DNA encontrados em bactérias. Elas são utilizados como vetores para a clonagem de genes e portanto fundamentais para o estudo de genes.

Sobre as características típicas encontradas em plasmídeos utilizados para clonagem, assinale a alternativa incorreta

Alternativas
Comentários
  • D) Incorreta

    Os fragmentos inseridos nos plasmídeos não podem exceder os 10000 pares de bases (10 Kb).


ID
1706182
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Uma série de técnicas são usualmente utilizadas para estudo da expressão de genes. Sobre técnicas de análise da expressão gênica, assinale a alternativa incorreta.

Alternativas
Comentários
  • alguém pode dizer pq a A está incorreta?

  • O Northern Blot não é uma técnica de PCR como o RT-PCR, ele é uma técnica de imobilização de ácidos nucléicos, sem necessidade de se utilizar a PCR
  • Sera porque o Northern necessitaria de mais material biológico para ser realizado do que o RT-PCR?

  • Pequena Concurseira, o Northern blot é uma técnica de avaliação da expressão gênica, mais especificamente de produtos da transcrição gênica, e necessita de grandes quantidades de RNA.


ID
1706185
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Uma forma de amplificar um fragmento de DNA é a clonagem em plasmídeo e a transformação de uma cepa bacteriana para posterior extração do DNA plasmidial. A classificação mais utilizada para plasmídeos é a baseada em características do DNA.

Sobre os cinco principais tipos de plasmídeos, assinale a alternativa incorreta

Alternativas
Comentários
  • Gab: LETRA E

    Plasmídios Col ou bacteriocinogênicos: plasmídios capazes de produzir inibidores de crescimento de outras bactérias


ID
1706188
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Transcriptomas podem ter uma alta complexidade e conter centenas de milhares de mRNAs diferentes, em diferentes proporções. Portanto, para caracterização do transcriptoma é necessário identificar e, idealmente, determinar as abundâncias relativas de cada transcrito.

Sobre as técnicas mais populares de análise de transcritoma, assinale a alternativa incorreta

Alternativas

ID
1706191
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Dentre as técnicas a seguir, assinale a que não é considerada uma técnica de genômica funcional.

Alternativas
Comentários
  • A genômica funcional usa principalmente técnicas multiplex para medir a abundância de muitos ou todos produtos de genes, tais como mRNAs ou proteínas dentro de uma amostra biológica.

    As alternativas C,D e E referem-se a "em larga escala".

     

    Microarranjo: técnica muito utilizada em pesquisas na área de genômica funcional

     

    https://pt.wikipedia.org/wiki/Gen%C3%B4mica_funcional


ID
1706194
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biologia
Assuntos

Um dos pontos mais importantes na reação de PCR é a razão ótima entre iniciadores e DNA molde.

Sobre esse tema, assinale a afirmativa incorreta

Alternativas

ID
1706197
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Dentre as sentenças abaixo, selecione aquela que descreve uma etapa não presente no procedimento de uma reação de PCR padrão.

Alternativas
Comentários
  • a)Resfriamento da amostra a 16 °C por 30 segundos a cada ciclo. (ERRADA) O resfriamento necessário para o anelamento é entre 30 e 65°C. 

  •  

    GABARITO A - Não tem etapa de resfriamento a cada ciclo.

     

    As etapas da PCR são:

    Desnaturação--> Anelamento--> Extensão.

     

     

     


ID
1706200
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Para o desenho do iniciadores ou oligonucleotídeos para reação de PCR, algumas orientações precisam ser seguidas de forma a garantir o sucesso da amplificação.

Selecione dentre as sentenças abaixo aquela que corresponde a uma orientação errada

Alternativas
Comentários
  • Alternativa D: ERRADA.

    Primers de um par não devem ter sequências similares, para que eles não se anelem uns aos outros.


ID
1706203
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

O PCR quantitativo pode ser utilizado para avaliar o nível de expressão de um determinado gene. No entanto, este ensaio apresenta um problema frequente que pode distorcer os resultados, a avaliação da amplificação de uma amostra que não está mais na fase exponencial de amplificação.

Assinale a alternativa com a melhor opção para resolver esse problema. 

Alternativas

ID
1706206
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

A alternativa que melhor define um gene de referência ou gene normalizador em um PCR quantitativo para avaliação da expressão é um gene:

Alternativas
Comentários
  • c) com expressão conspícua em todas as células.

    O legal de um gene com expressão conspicua (notável) é que você pode usar esse gene como referência na análise de diversos tipos de tecidos ou amostras biológicas. 


ID
1706209
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Sobre as diferenças entre o método didesoxi e o método de utilizado em sequenciadores automáticos, assinale a alternativa incorreta.

Alternativas
Comentários
  • Cadê os comentários dos professores e dos nerds ? Uma ajudaaaaaa!!!!!!!!

  • Erro da E: O sequenciamento automático ocorre em termociclador (PCR).


ID
1706212
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Os métodos de normalização são fundamentais para um experimento bem sucedido de microarranjos de DNA. Estes métodos são necessários para corrigir uma série de variáveis intrínsecas do experimento.

Dentre as afirmativas a seguir, assinale a que não corresponde a uma variável presente em um experimento de microarranjos de DNA. 

Alternativas
Comentários
  • Microarray detecta milhões de genes ao mesmo tempo.


ID
1706215
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

O principal problema na extração de RNA é a presença da enzima RNAse, responsável pela degradação do RNA. Esta enzima, na maioria das vezes, é derivada do próprio tecido de onde se objetiva a extração de RNA, mas também pode ser resultado de uma contaminação externa.

Selecione a alternativa que descreve uma forma ineficaz de proteção do RNA da ação das RNAses durante a extração. 

Alternativas

ID
1706218
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Microarranjos de DNA produzidos pela técnica de síntese in situ tem se tornado cada vez mais comum. Sobre a técnica de síntese in situ, analise as afirmativas a seguir.

I. No método piesoelétrico, quantidades mínimas de líquido da ordem de picolitros, são depositadas na superfície. No entanto, a uniformidade do elemento é de pior qualidade do que os métodos usuais baseados em deposição por pinos metálicos.

II. A produção de microarranjos de DNA por fotolitografia é o método usualmente utilizado pela empresa Affymetrix.

III. O método piesoelétrico não permite a impressão direta em lâminas de vidro de oligonucleotídeos de até 60 nucleotídeos.

Assinale: 

Alternativas

ID
1706221
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

O método de microarranjo por deposição de DNA pré-sintetizado é considerado de mais fácil implementação por instituições sem fins lucrativos como institutos de pesquisa ou universidades.

Sobre o método, assinale a afirmativa incorreta

Alternativas

ID
1706224
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Para a extração de RNA/DNA, uma das etapas mais importante é a eliminação das proteínas durante o processo de purificação. Para a eliminação de proteínas na extração de RNA/DNA, assinale a afirmativa inadequada.

Alternativas
Comentários
  •  a) Digestão das amostras com a enzima proteinase K. CORRETA. Proteinase K desnatura proteínas.

     b) Extrações com misturas de solventes orgânicos como fenol e clorofórmio por repetidas vezes. CORRETA. Permitem a separação do DNA no sobrenadante enquanto as proteínas ficam na camada intermediária.

     c) Solubilização em tampões de guanidina. CORRETA. O método de extração de DNA por guanidina está baseado nas propriedades de ligação de partículas de sílica ao DNA na presença de tiocianato de guanidina, que tem ação caotrópica e de inativação de nucleases. A técnica baseia-se na alteração de pH. Em condições de pH baixo (obtido pela adição de HCl), a sílica tem carga positiva para aderir à estrutura principal de ácidos nucleicos, carregados negativamente. 

     d) Precipitação salina. CORRETA. Técnica de salting-out que consiste na adição de grandes quantidades de sal, que causam a precipitação de macromoléculas como as proteínas, enquanto o DNA permanece em solução aquosa.

     e) Solubilização em tampões ácidos (pH menor que 3,5). ERRADA


ID
1706227
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

Recentemente, a tecnologia do RNA-sequencing (RNA-seq) vem sendo considerada como uma alternativa ao microarranjo de DNA para estudo da expressão gênica. Sobre as vantagens do RNA-seq quando comparado ao microarranjo de DNA, assinale a afirmativa incorreta.

Alternativas

ID
1706230
Banca
FGV
Órgão
FIOCRUZ
Ano
2010
Provas
Disciplina
Biomedicina - Análises Clínicas
Assuntos

A tecnologia de sequenciamento da Illumina ® é considera uma das principais formas de sequenciamento de última geração.

Sobre a tecnologia Illumina®, assinale a afirmativa incorreta

Alternativas
Comentários
  • Gabarito A.

     

    O princípio desta metodologia (Illumina) é similar ao método proposto por Sanger, pois temos em ambas a síntese de uma fita complementar ao DNA alvo utilizando DNA polimerase e nucleotídeos terminadores marcados com diferentes fluoróforos. A fluorescência emitida após a incorporação de cada nucleotídeo é registrada como imagem e no final, através de uma decodificação destas imagens, tem se a sequencia de interesse. Como toda técnica de sequenciamento de segunda geração, é preciso primeiro preparar as bibliotecas contendo o DNA a ser sequenciado. Assim, o DNA é clivado, os fragmentos de tamanho apropriado são selecionados e ligados à adaptadores em ambas as extremidades.